天然河溪是指天然水源從上游流下而形成的天然水道,包括流水終年不斷的常年河溪和只在雨季才有水流的間歇性河溪。河床為天然形成而非人工所造,由基岩、巨礫、卵石、碎石、砂粒、粉沙或黏土混合而成。至於河溪堤岸,基本上亦為天然形成,而且界限清晰可見,並長有植物。河溪佔地球表面的比例不到百分之一,但其生物多樣性卻是不成比例的高。它們充當了養分傳遞和生物移動的重要走廊,並作為眾多物種的覓食地和棲息地。

香港的地形以山巒深谷為主,平地主要集中在沖積平原和沿岸區域。在這片群山起伏的土地上,數以百計的小溪澗於深山丘壑之中奔騰,溪水順山勢而下,越近源頭的高處水流越急,越近平地則越見紓緩。至於又長又彎的河流,本港並不多見,僅有的數條全部位於新界北部和西北部的沖積平原。

本港天然河流溪澗的總長度超過2,500公里,大部分位於鄉郊地區山坡。這些天然河溪很多都是各種野生動植物的理想生境。天然河溪不但具備重要的生態功能,在景觀方面價值亦非常高。
猴塘溪河岸植被為河流中很多水生生物提供食物,又可遮擋陽光,從而調節溪水溫度。水龍是其中一種本地常見的河岸植物 。紫身枝牙鰕虎魚是受保育關注的淡水魚類,在香港的分布侷限,雄魚全身金屬藍色。大型無脊椎動物如蟹、蝦、蜻蜓、蜉蝣、石蠅和石蛾(見圖)等的整個幼蟲期(有些甚至整個生命週期)都在河溪中度過。牠們是河流生態系統的重要部分,也是鑑定河溪水質的常用指標。香港纖春蜓為香港特有種,廣泛分布於本港樹林中的小溪。棘胸蛙是香港體型最大的蛙類,只分布於大帽山的高地溪流。棲息於河溪的香港瘰螈是香港唯一的蠑螈類物種,每個個體腹部的橙色斑紋都是獨特的。在香港的山溪有機會找到被世界自然保護聯盟《瀕危物種紅色名錄》列為「極度瀕危」的三線閉殼龜。