香港的海域蘊藏著令人驚嘆的生命寶藏。雖然我們的海洋面積有限，且長期承受城市發展帶來的巨大壓力，但這裡卻養育著驚人的生物多樣性——目前已記錄約6,000種海洋物種，其中魚類超過1,100種，隸屬148科，約佔整個南海魚類多樣性的30%。這片亞熱帶河口環境由珠江淡水與海洋水流交匯而成，形成了多樣化的棲息地，為眾多魚類、海豚及其他海洋生物提供了重要的覓食和育幼場所。

過去，科學家主要依賴傳統的捕魚方法，如使用重型漁網進行底拖網調查，以探索海底世界。這種方法雖能提供部分數據，但其局限性也十分明顯：不僅會破壞脆弱的棲息地，成本高昂、耗時費力，還往往忽略了生活在中上層水域、躲藏在複雜環境中的物種，以及那些稀有或膽小的生物。自2012年底全面實施底拖網禁令後，尋找一種更溫和、更全面的監測方式，以評估生態恢復狀況並指導保育工作，變得尤為迫切。

環境DNA（eDNA）宏條碼技術的出現，為這一難題帶來了突破性的解決方案。這種方法無需直接捕撈生物，而是透過採集生物遺留在海水中的微量遺傳物質，進行物種鑑定。研究人員只需過濾水樣，再利用先進的基因分析技術，便能快速、無損地識別物種——既不需要漁網，也不會對生物造成傷害，同時避免了傳統方法對隱蔽或中上層物種的採集偏差。

本研究是香港都市化河口水域首個直接比較eDNA宏條碼技術與傳統底拖網調查成效的案例。於2022年4月至5月期間，我們在香港南部水域進行了16次底拖網採樣，並同步收集了32個水樣進行eDNA分析。透過使用多個專用基因標記和高通量測序技術，我們得以描繪出一幅更全面的生物多樣性圖景。

結果令人驚嘆。傳統底拖網僅偵測到106種魚類和3種魟魚，而eDNA技術則識別出237種魚類和6種魟魚——物種數超過前者的兩倍，當中包括142種底拖網完全未能發現的魚類。此外，eDNA方法檢測到的受威脅脊椎動物也遠多於底拖網（16種對比4種），例如被列為極危的大黃魚（在半數以上站點中出現）、瀕危的扯旗鱲（所有站點均有分佈），以及易危的中華白海豚。不僅如此，eDNA技術不僅鑑定出更多魚類物種，還揭示了更清晰的空間分佈模式：不同區域的魚類群落結構存在顯著差異，且與濁度、溶氧量和營養鹽濃度等水質因子密切相關。

雖然在甲殼類動物的檢測上，底拖網略勝一籌，但eDNA同樣識別出多個關鍵物種。隨著未來基因數據庫的不斷完善，eDNA在這一類群的應用潛力也將進一步提升。總體而言，本研究突顯了eDNA宏條碼技術作為一種更快速、更低干擾、更全面的監測工具的優勢。它能在不破壞生態的前提下，揭示海洋中隱藏的生物多樣性，追蹤生態系統的動態變化，為禁拖後的有效保育、生態恢復監測、瀕危物種保護以及香港珍貴海洋遺產的可持續管理，提供科學依據與務實指引。

完整論文：https://doi.org/10.1002/edn3.70031