香港的海域蕴藏著令人惊叹的生命宝藏。虽然我们的海洋面积有限，且长期承受城市发展带来的巨大压力，但这里却养育著惊人的生物多样性——目前已记录约6,000种海洋物种，其中鱼类超过1,100种，隶属148科，约占整个南海鱼类多样性的30%。这片亚热带河口环境由珠江淡水与海洋水流交汇而成，形成了多样化的栖息地，为众多鱼类、海豚及其他海洋生物提供了重要的觅食和育幼场所。

过去，科学家主要依赖传统的捕鱼方法，如使用重型渔网进行底拖网调查，以探索海底世界。这种方法虽能提供部分数据，但其局限性也十分明显：不仅会破坏脆弱的栖息地，成本高昂、耗时费力，还往往忽略了生活在中上层水域、躲藏在复杂环境中的物种，以及那些稀有或胆小的生物。自2012年底全面实施底拖网禁令后，寻找一种更温和、更全面的监测方式，以评估生态恢复状况并指导保育工作，变得尤为迫切。

环境DNA（eDNA）宏条码技术的出现，为这一难题带来了突破性的解决方案。这种方法无需直接捕捞生物，而是透过采集生物遗留在海水中的微量遗传物质，进行物种鉴定。研究人员只需过滤水样，再利用先进的基因分析技术，便能快速、无损地识别物种——既不需要渔网，也不会对生物造成伤害，同时避免了传统方法对隐蔽或中上层物种的采集偏差。

本研究是香港都市化河口水域首个直接比较eDNA宏条码技术与传统底拖网调查成效的案例。于2022年4月至5月期间，我们在香港南部水域进行了16次底拖网采样，并同步收集了32个水样进行eDNA分析。透过使用多个专用基因标记和高通量测序技术，我们得以描绘出一幅更全面的生物多样性图景。

结果令人惊叹。传统底拖网仅侦测到106种鱼类和3种魟鱼，而eDNA技术则识别出237种鱼类和6种魟鱼——物种数超过前者的两倍，当中包括142种底拖网完全未能发现的鱼类。此外，eDNA方法检测到的受威胁脊椎动物也远多于底拖网（16种对比4种），例如被列为极危的大黄鱼（在半数以上站点中出现）、濒危的扯旗鱲（所有站点均有分布），以及易危的中华白海豚。不仅如此，eDNA技术不仅鉴定出更多鱼类物种，还揭示了更清晰的空间分布模式：不同区域的鱼类群落结构存在显著差异，且与浊度、溶氧量和营养盐浓度等水质因子密切相关。

虽然在甲壳类动物的检测上，底拖网略胜一筹，但eDNA同样识别出多个关键物种。随著未来基因数据库的不断完善，eDNA在这一类群的应用潜力也将进一步提升。总体而言，本研究突显了eDNA宏条码技术作为一种更快速、更低干扰、更全面的监测工具的优势。它能在不破坏生态的前提下，揭示海洋中隐藏的生物多样性，追踪生态系统的动态变化，为禁拖后的有效保育、生态恢复监测、濒危物种保护以及香港珍贵海洋遗产的可持续管理，提供科学依据与务实指引。

完整论文：https://doi.org/10.1002/edn3.70031